De Alaska Malamute heeft zijn naam te danken aan de Mahlemuts, een eskimostam in Alaska. De betekenis van het woord Mahlemut is: “mensen die wonen op de plek van de hoge golven”. Ze woonden rond de Golf van Kotzebue en de Nortonbaai, vanzelfsprekend leefden ze voornamelijk van visvangst. De Mahlemuts stonden bekend om hun grote zorg en respect voor hun honden. Dat spreekt ook voor zich, vanwege de extreme omstandigheden waaronder ze leefden waren de Mahlemuts erg op hun honden aangewezen om te overleven. Gezondheid en fitheid van de honden waren daarvoor essentieel.
Er werd zorgvuldig met het fokprogramma omgegaan. Alleen met de honden die het sterkst waren, het beste aan de omstandigheden waren aangepast en zich het best door de sneeuw konden verplaatsen werd gefokt. Naast uitstekende werkers waren de honden richting mensen van nature vriendelijk en zacht. Dat maakte ze ook als gezelschapsdier aangenaam. Op films die aan het begin van de 20ste eeuw gemaakt zijn bij de Eskimo’s is dit gedrag duidelijk terug te zien.
De goudkoorts heeft de Alaska Malamute beslist geen goed gedaan. Toen er in Alaska goud gevonden werd kregen veel Eskimo’s een meer vaste verblijfplaats en waren de honden minder nodig voor hun bestaansrecht. Daarnaast werden de sledehondenrennen steeds populairder en werden de oorspronkelijk honden gekruist met de snellere Europese bergrassen.
Rond 1920 begonnen in de Verenigde Staten enkele enthousiastelingen te fokken met als doel de honden naar het oorspronkelijke hoge peil van de Mahlemuts te brengen. Belangrijke namen zijn die van Arthur Walden, Milton en Eva Seeley (chinook-kennel), Paul Voelker (M’Loot-kennel) en Dick Hinman. In 1935 werd de Alaska Malamute als officieel ras door de Amerikaanse Kennelclub erkent. In dat jaar werd de Amerikaanse Alaska Malamute club opgericht.
In de tweede Wereldoorlog ging het opnieuw slecht met de Alaska Malamute. Veel honden werden ingezet als sledehond tbv de militaire basissen langs de kust in de poolstreken. Na de oorlog heeft Robert Zoller (Husky-pak-kennel) een belangrijke rol gespeeld in het redden van de Alaska Malamute.